Воздушный флот организации WILLE, состоящий из мощных Евангелионов, взмывает в небо для проведения парижской операции. Они сражаются с армией беспилотных роботов, защищая город от угрозы исчезновения. В ходе операции им удается активировать гигантский уплотнительный столб, который помогает восстановить разрушенный гетто и привлечь внимание к запчастям и боеприпасам для Евангелионов. Тем временем Синдзи, потерявший волю к жизни после потери Каору и провала Четвертого удара, начинает следовать за Аской и Рэй. Они попадают в Третью деревню, где